Ce jumelage est à l'initiative des directeurs du lycée allemand d'Eberbach et du collège de Thonon. La première rencontre officielle s'est déroulée en Allemagne le 29 avril 1961 entre les deux maires, M. PIANTA et Dr SCHMEISSER. Deux mois plus tard, ce sont les élus allemands qui se sont rendus en France.

Les 24 et 25 juin 2011, les deux villes fêterons leurs 50e anniversaire. Plusieurs animations se dérouleront à Thonon.

La Ville de Thonon-les-Bains est jumelée avec la Ville de Mercer Island depuis juillet 2000. Mercer Island est une île située au milieu du lac Washington à quelques kilomètres de Seattle, sur la côte Nord Ouest des Etats Unis.

C'est l'association Thonon France Léman Sister City qui gère les échanges avec Mercer Island (http://thononfranceleman.over-blog.net).

Pour le 5e anniversaire du jumelage, qui coïncidait avec l'inauguration d'un nouveau community center (centre culturel) à Mercer Island, la Ville de Thonon a mis à disposition de sa "ville soeur", d'octobre 2005 à mai 2006, sa très belle collection de gravures et lithographies des 18e et 19e siècles, représentant les rives lémaniques. Cette collection avait déjà été exposée à Eberbach quelques années auparavant.

A l'occasion du 10e anniversaire du jumelage entre Thonon les Bains et Mercer Island une délégation de 17 personnes menée par le Maire de Mercer Island, Jim Pearman, et la présidente de l'association Mercer Island Sister City, Jane Meyer Brahm, était présente à Thonon du 29 mai au 6 juin 2010.